Il territorio maruggese si estende nella penisola salentina; è prevalentemente pianeggiante, con leggere ondulazioni, che raggiungono l'altitudine massima di circa 90 m s.l.m., nella parte a nord del paese.
Mancano corsi d'acqua, ad eccezione di un piccolo torrente detto Canale del Celso alimentato da risorgive.
La costa è prevalentemente sabbiosa, con tratti rocciosi nella parte più orientale, in località Monaco Mirante.